Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prdm1Q60636 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms