Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CttnQ60598 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CttnQ60598 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms