Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sin3aQ60520 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sin3aQ60520 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms