Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brip1Q5SXJ3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brip1Q5SXJ3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms