Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SynrgQ5SV85 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SynrgQ5SV85 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms