Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psme4Q5SSW2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psme4Q5SSW2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms