Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc88aQ5SNZ0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms