Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SynaQ5G5D5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SynaQ5G5D5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms