Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkaa1Q5EG47 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms