Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrc8bQ5DU41 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms