Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccnl1Q52KE7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccnl1Q52KE7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccnl1Q52KE7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccnl1Q52KE7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnl1Q52KE7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnl1Q52KE7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnl1Q52KE7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnl1Q52KE7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnl1Q52KE7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnl1Q52KE7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnl1Q52KE7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnl1Q52KE7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccnl1Q52KE7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms