Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Shank3Q4ACU6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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