Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt35Q497I4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms