Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Fam220aQ3ZN08 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam220aQ3ZN08 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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