Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm906Q3V0M1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm906Q3V0M1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms