Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930596D02RikQ3V0H9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms