Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp48Q3V0C5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp48Q3V0C5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms