Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc27Q3V036 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc27Q3V036 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms