Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hipk4Q3V016 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms