Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Rnpc3Q3UZ01 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnpc3Q3UZ01 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms