Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn4Q3UWL8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfdn4Q3UWL8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms