Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fchsd2Q3USJ8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fchsd2Q3USJ8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fchsd2Q3USJ8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Fchsd2Q3USJ8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fchsd2Q3USJ8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fchsd2Q3USJ8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms