Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cobll1Q3UMF0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cobll1Q3UMF0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms