Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rmdn3Q3UJU9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms