Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp19Q3UJD6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Usp19Q3UJD6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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Usp19Q3UJD6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Usp19Q3UJD6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp19Q3UJD6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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