Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm648Q3UJ22 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm648Q3UJ22 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm648Q3UJ22 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm648Q3UJ22 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Gm648Q3UJ22 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm648Q3UJ22 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm648Q3UJ22 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm648Q3UJ22 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm648Q3UJ22 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm648Q3UJ22 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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