Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pid1Q3UBG2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms