Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brf2Q3UAW9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms