Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms