Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q3U6N9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U6N9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U6N9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q3U6N9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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