Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q3U595 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q3U595 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q3U595 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms