Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rnf40Q3U319 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rnf40Q3U319 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rnf40Q3U319 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Rnf40Q3U319 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnf40Q3U319 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf40Q3U319 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnf40Q3U319 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnf40Q3U319 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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