Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sec24aQ3U2P1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms