Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Palb2Q3U0P1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms