Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srsf6Q3TWW8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Srsf6Q3TWW8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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