Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smarca4Q3TKT4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca4Q3TKT4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms