Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nlrp4cQ3TKR3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms