Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp39Q3TIX9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms