Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hdgfl1Q2VPR5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hdgfl1Q2VPR5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms