Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpusd3Q14AI6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd3Q14AI6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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