Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp2b3Q0VF55 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms