Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc21bQ0HA38 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc21bQ0HA38 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms