Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou6f1Q07916 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms