Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms