Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bp2Q06649 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bp2Q06649 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms