Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PtprgQ05909 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprgQ05909 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms