Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GscQ02591 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GscQ02591 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GscQ02591 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GscQ02591 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GscQ02591 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GscQ02591 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms