Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxd1Q01822 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd1Q01822 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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