Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nme2Q01768 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms