Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms